El 9 de septiembre de 1893, Celina Bustamante de Beláustegui donó un terreno para que los mercedarios construyeran su escuela e iglesia. La primera y precaria capilla fue diseñada y construida en 1894 por el padre Ángel Páez. Esta sería la predecesora de una segunda capilla diseñada por el padre Nicolás González tres años después.

El alma mater de la basílica fue el padre José Már- quez, quien se puso en contacto con el arquitecto salesiano Ernesto Vespignani. El templo, inspirado en la iglesia del Sagrado Corazón de Turín, fue consagrado el 18 de junio de 1935. Es de estilo gótico-lombardo, tiene cinco naves que rodean el ábside y una cúpula debajo de la cual está el altar de granito. Las torres tienen 75 metros de altura.